Изобретение относится медицине, а именно к системам ускорения ионов для адронной терапии, и может быть использовано для ускорения пучков ядер (например, 12C6+) или молекул (например, Н+2). Ускоряющая система для составных заряженных частиц с массовым числом, превышающим 1, включает обычный или сверхпроводящий циклотрон, радиочастотный линейный ускоритель (РЛУ), линию транспортировки пучка средней энергии (МЕВТ) и линию транспортировки пучка высокой энергии (НЕВТ). Линия МЕВТ присоединена на одном конце к выходу циклотрона или к выходу первой части радиочастотного линейного ускорителя, а на другом конце - к входу линейного радиочастотного ускорителя или ко второй части указанного радиочастотного линейного ускорителя. Линия НЕВТ присоединена на одном конце к выходу радиочастотного линейного ускорителя, а на другом конце - к системе для распределения дозы облучения пациенту. Изобретение позволяет уменьшить потребление энергии и добиться значительной компактности, что позволяет устанавливать его в лечебных структурах, а также позволяет оперативно изменять энергию и ток терапевтического пучка, имеющего малый эмиттанс и временную структуру, адаптированную для распределения дозы облучения на основе метода, известного как «сканирование пятном». 7 з.п. ф-лы, 3 ил.