WO 2004011909 A2, 05.02.2004. БРАТУСЬ А.В. и др. Применение метода LOGIS для предсказания вторичной структуры белка. Биополимеры и клетка. 1998, т.14, 2, с.156-162. БРАТУСЬ А.В. и др. Предсказания вторичной структуры белков модифицированным GUHA-методом. Биополимеры и клетка. 1993, т.9, 5, с.61-64.
Имя заявителя:
Государственное образовательное учреждение высшего профессионального образования "Санкт-Петербургский государственный электротехнический университет "ЛЭТИ" им. В.И. Ульянова (Ленина)" (RU)
Изобретатели:
Карасев Владимир Александрович (RU) Лучинин Виктор Викторович (RU)
Патентообладатели:
Государственное образовательное учреждение высшего профессионального образования "Санкт-Петербургский государственный электротехнический университет "ЛЭТИ" им. В.И. Ульянова (Ленина)" (RU)
Реферат
Изобретение относится к области биоинформатики и биотехнологии, в частности к прогнозированию вторичной структуры белка, и может быть использовано в молекулярной биологии и медицине. Положение -спиральных, -структурных фрагментов и изгибов -структуры в последовательности аминокислот белка прогнозируют с помощью специально написанной программы PREDICTOR путем сравнения выделяемых в рабочем файле исследуемого белка последовательно, со сдвигом в одну аминокислоту фрагментов из пяти аминокислот (пентафрагментов), начиная с N-конца белка, со специально созданной базой данных пентафрагментов белков, введенной в память компьютера и полученной с помощью специально написанных программ на основе файлов с координатами атомов структур белков из свободного доступа Protein Data Bank. На основе сведений о номерах папок, последовательно внесенных в рабочий файл для всех выделенных в последовательности аминокислот пентафрагментов, определяют положение -спиральных, -структурных фрагментов и изгибов -структуры в первичной структуре белка, по которым судят о вторичной структуре исследуемого белка. 18 табл.
Поиск патентов
Получить полное описание патента