Изобретение относится к способам и устройствам для комплексной очистки природной воды и хозяйственно-бытовых сточных вод с получением питьевой воды с улучшенными биологическими и физическими свойствами и может быть использовано в медицине, пищевой промышленности, сельском хозяйстве и других областях. Способ включает насыщение поступающей воды кислородом в аэрационной камере 1 посредством придонных аэраторов 3. Далее небольшие порции воды транспортируют в магнитную камеру 6 с помощью эрлифта 4. Магнитную обработку воды осуществляют в переменном магнитном поле посредством транспортировки аэрированной воды через кольцевое пространство, образованное набором постоянных магнитов, расположенных с чередованием полярности. После магнитной обработки осуществляют ультрафиолетовую обработку воды в устройстве 7. Обработанную воду подают к пассивному фильтру 12 и далее в накопитель. При этом все процессы воздействия на воду многократно повторяют с рециркуляцией очищаемой воды. Аэрационная камера и накопитель очищенной воды могут быть выполнены в виде раздельных емкостей 28 и 29, связанных каналом перетока 18 очищенной воды на рециркуляцию. При этом пассивный фильтр 12 расположен за пределами емкостей. Изобретение способствует улучшению способа очистки питьевой воды и упрощению установки, уменьшению энергозатрат на очистку воды при достижении безаварийного режима и повышении надежности ее работы. 2 н. и 7 з.п. ф-лы, 4 ил.