ЗОНД И НАБОР (ВАРИАНТЫ) ДЛЯ ДЕТЕКЦИИ ЦЕЛЕВОЙ НУКЛЕИНОВОЙ КИСЛОТЫ, СПЕЙСЕР, ПОДХОДЯЩИЙ ДЛЯ ПРИСОЕДИНЕНИЯ К СПЕЦИФИЧЕСКОЙ К МИШЕНИ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ ЗОНДА И СПОСОБ ДЕТЕКЦИИ ЛЮБОГО ВЗАИМОДЕЙСТВИЯ МЕЖДУ ЗОНДОМ И ЦЕЛЕВОЙ НУКЛЕИНОВОЙ КИСЛОТОЙ
XU HONGXIA et al. Multiplexed SNP genotyping using the Qbead system: a quantum dot-encoded microsphere-based assay// NUCLEIC ACIDS RESEARCH. - 2003, v.31, no.8б p.e 43. KALLER M et al. Microarray-based AMASE as a novel approach for mutation detection// MUTATION RESEARCH. - 2004, v.554, no.1-2, p.77-88. GUO Z et al. Direct fluorescence analysis ofgenetic polymorphisms by hybridization with oligonucleotide arrays on glass supports. Nucleic acids research, OXFORD UNIVERSITY PRESS, 1994, v.22, no.24, p.5456-5465. KI JANG-SEU et al. A low-density oligonucleotide array study for parallel detection of harmful algal, species using hybridization of consensus PCR products of LSU rDNA D2 domain// BIOSENSORS & BIOELECTRONICS. - 2006, v.21, no.9, p.1812-1821. DIAZ MARA R et al. High-throughput detection of pathogenic yeasts of the genus trichosporon// JOURNAL OF CLINICAL MICROBIOLOGY. - 2004, v.42, no.8, p.3696-3706. KIM et al. Development and evaluation of a highly sensitive human papillomavirus genotyping DNA chip// GYNECOLOGIC ONCOLOGY. - 2006, v.100, no.1, p.38-43. RU 2077593 C1, 20.04.1997.
Изобретение относится к области биотехнологии, а именно к зонду для детекции и набору (варианты) для детекции целевой нуклеиновой кислоты, спейсеру, подходящему для присоединения к специфической к мишени последовательности зонда и способу детекции любого взаимодействия между заявленным зондом и целевой нуклеиновой кислотой. Зонд содержит: связывающую группу, которая делает возможным связывание зонда с поверхностью подложки в виде частиц; спейсер и мишень-специфическую олигонуклеотидную последовательность зонда. Спейсер содержит: олигонуклеотидный спейсер из по меньшей мере 20 нуклеотидов между специфической к мишени последовательностью зонда и группой, связывающейся с подложкой, содержащий гомополимерный политиминовый спейсер или гетерополимерный спейсер из повторяющихся нуклеотидных звеньев, выбранных из группы, состоящей из TTG, TTTG, AAG, AAC, AAAG и АААС; и возможно углеродный спейсер из 12-30 углеродных звеньев между специфической к мишени последовательностью зонда и группой, связывающейся с подложкой. Предложенное изобретение позволяет детектировать целевую нуклеиновую кислоту и увеличить соотношение сигнала к шуму в наборах. 7 н. и 18 з.п. ф-лы, 4 ил., 42 табл., 12 пр.